Лапшина Елена Дмитриевна
директор НОЦ, доктор биологических наук, профессор
e_lapshina@ugrasu.ru
Лаборатория изучения пространственно-временной изменчивости углеродного баланса лесных и болотных экосистем средней тайги Западной
Сибири
В октябре 2022 года в рамках национального проекта «Наука и университеты» в Югорском государственном университете была создана молодежная лаборатория «Лаборатория изучения пространственно-временной изменчивости углеродного баланса лесных и болотных экосистем средней тайги Западной Сибири» (сокращенно – Лаборатория геоинформатики экосистем, МолГисЛаб) под руководством молодого ученого Ильясова Д.В. Одним из основных условий прохождения конкурсного отбора при создании лаборатории являлся состав ее участников: возраст руководителя не должен превышать 35 лет, общая доля молодых исследователей до 39 лет в коллективе должна составлять не менее 70%. Для сотрудников лаборатории в штатном расписание ЮГУ были подготовлены новые ставки: помимо заведующего нового структурного подразделения – младших научных сотрудников, научных сотрудников, старших научных сотрудников и лаборантов. Общая численность нового коллектива составила 13 человек.
Целью создания лаборатории является создание распределенной по времени геоинформационной системы (ГИС), позволяющей проводить оценку величины компонентов углеродного баланса в типичных лесных и болотных экосистемах средней тайги Западной Сибири. ГИС будет содержать в себе возможность проведения численных экспериментов методами математического моделирования для оценки влияния климатических изменений и антропогенной активности на компоненты углеродного баланса и формулировки прогнозных сценариев его динамики.
Заведующий лабораторией Ильясов Данил Викторович
Лаборатория экосистемно-атмосферных связей лесоболотных комплексов
Цель проекта
Создание научного, инфраструктурного и образовательного потенциала в составе Западно-Сибирского НОЦ для реализации научных исследований мирового уровня в сфере изучения механизмов современных природно-климатических изменений и внедрения их результатов в практику.
Задачи проекта
Лаборатория позволит создать научный, образовательный и инфраструктурный потенциал для решения актуальных научно-практических задач, связанных с выполнением стратегических целей Российской Федерации в области смягчения изменений климата и адаптации в Арктике.
Во временном отрезке финансирования проекта в Лаборатории будут созданы следующие продукты: три действующих измерительных полигона мониторинга потоков парниковых газов, методические рекомендации по оценке лесных и болотных экосистем в качестве источников и поглотителей парниковых газов в условиях меняющегося климата и антропогенного воздействия, математические модели для экстраполяции данных локальных наблюдений, тематические карты состояния экосистем, база данных характеристик экосистем, разработанные программы дисциплин в форме курсов, составленных на основе результатов научных исследований, подготовлено не менее 50 молодых специалистов, повышена квалификация молодых ученых, организован постоянно действующий проблемный научный семинар, подготовлено не менее 48 научных публикаций с результатами проекта за 5 лет в журналах из БД “Web of Science”.
Заведующий лабораторией Ольчев Александр Валентинович
Лаборатория разработки методики метагеномного анализа для экспресс-оценки воздействий на среду в условиях интенсивного
недропользования
В 2021 году в рамках национального проекта «Наука и университеты» создана Молодежная лаборатория «Разработки методики метагеномного анализа для экспресс-оценки воздействий на среду в условиях интенсивного недропользования». С 2024 года лаборатория выполняет работу в рамках Госзадания «Молекулярно-генетические методы в изучении и оценке состояния биоразнообразия Северных регионов».
Целью лаборатории является интеграция современных методов в изучение и мониторинг биоты с акцентом на изучение сообществ грибов.
Основные результаты работы:
- Организована молекулярная лаборатория (запущено оборудование и подготовлены кадры) для секвенирования по Сэнгеру (Applied Biosystems 3500) и секвенирования третьего поколения (Nanopore MinION).
- Разработаны методические указания протоколов работы, апробированы пайплайны обработки данных и способы представления исходных данных онлайн.
- Основные результаты работы Начато систематеческое секвенирование по Сэнгеру — баркодинг Биологической коллекции ЮГУ. В базу данных коллекции загружено около 1000 сиквенсов.
- Данные публикуются на международных порталах GenBank, BOLD и GBIF. На основе сиквенсов опубликованы статьи о структуре сообществ, новых находках и новых для науки видах.
- Подготовлена и реализована программа повышения квалификцаии в области молекулярно-генетических методов изучения биоразнообразия. В рамках летних школ прошли обучение около 50 научных сотрудников и студентов ХМАО-Югры и других регионов России.
- Апробирован протокол полевой работы и выполнен отбор проб для метабаркодинга сообществ грибов лесных и болотных экосистем. Тотальная ДНК отсеквенирована на платформах Illumina MiSeq и Nanopore MinION. Получено около 50 млн последовательностей сиквенсов (ридов).
- Написан пайплайн обработки данных метабаркодинга грибов.
- Опубликованы статьи по результатам баркодинга и метабаркодинга сообществ грибов.
- Продолжается пополнение коллекции ваучерных образцов Фунгария ЮГУ.
- Данные коллекции представлены на портале коллекций и публикуются в виде наборов данных в GBIF. В базе данных хранятся последовательности и метаданные сиквенирования.
- Идет оцифровка и мобилизация литературных данных о находках грибов на территории Западной Сибири.
- Всего мобилизовано около 55 тысяч находок. Данные организованы в виде четырех опубликованных наборов
Заведующая лабораторией Филиппова Нина Владимировна